Bonjour,
Nous réalisons un TIPE su Dictyostelium Discoideum, ou amibe sociale, et nous étudions plus particulièrement son chimiotactisme en carence nutritionnelle.
Pour notre première expérience, nous devons quantifier l'agrégation en fonction de la carence nutritionnelle. Pour cela nous allons observer les agrégats au microscope, mais il nous faudrait un programme permettant à partir de la photo de déterminer si elles sont agrégées, et de pouvoir quantifier l'agrégation. Notre professeur nous a dit qu'il devait surement exister des programmes informatiques, ou des logiciels permettant ce style de traitement d'image. Je viens donc vers vous pour savoir si vous en connaissez.
Merci d'avance de vos réponses.
Ludivine
TIPE - BCPST Traitement d'image
Re: TIPE - BCPST Traitement d'image
tu as probablement besoin de morphologies mathématiques. Si j'ai bien compris, tu seras intéressée par l'opérateur de fermeture (ou closing).
Des petits programmes comme ImageJ https://imagej.nih.gov/ij/download.html sont très biens pour expérimenter en image processing. Avec toutes les extensions qu'on peut trouver, il doit y avoir de quoi s'amuser. Il y a ca par exemple quand je cherche sur gogole http://imagej.net/MorphoLibJ , mais vous pouvez probablement en trouver d'autre si ca ne vous convient pas.
Au pire tu peux demander conseil à des gens ici http://bigwww.epfl.ch/people.html du labo de biomedical imaging group. Avec un peu de chance un des post-docs vous répondra (n'allez pas embêter le professeur avec ça, il a probablement mieux à faire ^^ )
Des petits programmes comme ImageJ https://imagej.nih.gov/ij/download.html sont très biens pour expérimenter en image processing. Avec toutes les extensions qu'on peut trouver, il doit y avoir de quoi s'amuser. Il y a ca par exemple quand je cherche sur gogole http://imagej.net/MorphoLibJ , mais vous pouvez probablement en trouver d'autre si ca ne vous convient pas.
Au pire tu peux demander conseil à des gens ici http://bigwww.epfl.ch/people.html du labo de biomedical imaging group. Avec un peu de chance un des post-docs vous répondra (n'allez pas embêter le professeur avec ça, il a probablement mieux à faire ^^ )
The Axiom of Choice is obviously true, the Well-Ordering Principle is obviously false, and nobody knows about Zorn's Lemma. - Jerry Bona
Re: TIPE - BCPST Traitement d'image
Merci beaucoup de tous ces conseils bullquies