Warning si tu prends le RER, c'est quand même assez souvent en grève, voir en travaux le Samedi, et ça marche souvent mal (plus ou moins évidemment suivant les lignes).
Regarde les temps de correspondance utilisés, suivant les applications ils sont plus ou moins serrés (et donc pas faisable en vrai).
Pars bien de chez toi et pas de la Gare, idem à l'arrivée.
Mais globalement 2h de transport par jour, même en prenant 2 x 20' de travail possible (ce qui me parait bcp et d'un niveau d'efficacité faible), tu 'perds' 1h20 d'activité par jour. Que ce soit travail / détente d'ailleurs.
Après, il est impossible d'interclasser des choux et des carottes, donc quel impact de cette perte par rapport à l'impact d'avoir un lycée "mieux" (avec toutes les limites de cette notion pour un lycée).
La solution 'sage' serait peut-être de prendre celui à coté de chez toi, de t'y épanouir, et si il s'avère que tu penses réussir mieux ailleurs, de changer en 2ème année.
Pour l'internat en cours d'année, il y a toujours des places qui peuvent se libérer (des 5/2 qui reviennent pas / des gens qui abandonnent, etc), et donc des attributions possibles. Mais tu ne seras pas forcément prioritaire, et c'est absolument incertain. Il faut partir du principe que les internats ont tout interet à être plein, les places ne vont donc pas apparaitre par magie.