Les classements des facs ne sont pas un indice d'employabilité ou de satisfaction employeur, donc méfiance avec ceux-ci. Ils évaluent surtout la recherche académique en général.
Quitte à tenter les concours d'ingé via la fac ou la prépa, autant tenter par la prépa (il y a les écoles les plus cotées), tu pourras a priori retenter par la fac c'est assez classique.
C'est une question de risques à prendre, mais il ne faut pas sous-estimer la difficulté de réussir un cursus universitaire (écrémage important comme dit au-dessus), ni sur-estimer la difficulté de la prépa qui ouvre à bcp de formations très reconnues et de qualité tout en restant relativement accessibles (il n'y a pas que le top 20 qui vaut le coup).
Ce qui va t'intéresser sera de savoir si un M2 suite à un cursus universitaire te donnera plus ou moins d'opportunités qu'un cursus ingénieur spécialisé dans le domaine